Trata de una extraña relación entre un estudiante llamado Yusuke y unas hermosas gemelas, Yuika y Rika, quien las salva del ataque de un perro salvaje. A partir de ese momento ellas quedan enamoradas de su joven héroe, pero hay un problema con Yusuke les tiene fobia a las mujeres.
Air Gear cuanta la historia del típico líder joven, Minami Itsuki akaIkki, de una banda juvenil que representa al instituto Higachu del lado Este de Gunz, Higachu Gunz. Después de ser humillado por otra banda callejera de Storm Riders que usan AT ( Air Treck), las hermanas Noyamano le regalan un par de Air Treck y le ayudarán a derrotar al adversario. Cuando termina el enfrentamiento, la agradable sensación de poder volar se apodera de Ikki y decide integrarse en el mundo del Air Treck.
Yoshitaka, un joven heredero, pierde a sus padres en un accidente. Como consecuencia recibe una herencia millonaria y queda como propietario único de todas las posesiones de sus padres. Debido a que se siente muy sólo en su enorme mansión, pone un anuncio de contratación de personal, al que responden dos hermanas que se han fugado de casa, huyendo de su padre, que no acepta a su mascota, y deciden aceptar la oferta, dado que no tienen donde quedarse. Así es como Mitsuki e Izumi Sawatari, un par de hermosas y adorables jovencitas, conocen a Yoshitaka, que resulta ser un pervertido de gran nivel que satisface sus fantasías fetichistas obligando a sus nuevas empleadas a vestirse con unos vestidos de lo más sugerentes.
Shungo es un estudiante de secundaria, vive en una mansión. Un día, su hermana Ryoko le envía a Mayu y Mikihiro, para vivir con él y así Mayu pueda superar su problema. El problema de Mayu es la androfobia, Ryoko usa varios métodos para curar su enfermedad utilizando a Shungo, como hacer que compartan la misma habitación, se bañen juntos, e incluso duerman juntos en la misma cama. Todo empeora cuando Reika Hōjō, la presidente del consejo estudiantil, termina de alguna manera siendo su criada.
Yukinari, es un estudiante como cualquier otro, con la unica diferencia que siempre ha sido mas bajo de estatura que los demas de su edad y a causa de eso las mujeres siempre lo han tratado mal; por este motivo, desarrolló una ginefobia (fobia a las mujeres) por lo que si las mujeres lo tocan, le sale urticaria (algun tipo de alergia en la piel). La vida de Yukinari cambiara completamente cuando por casualidades de la vida viaja a traves de la bañera de su casa hasta otro planeta llamado Seiren donde se encuentra con Miharu quien es la unica mujer a la que realmente puede tocar sin sufrir de urticaria (y que ademas es de su estatura), Seiren es un planeta donde el 96% de la población son mujeres y los hombres son muy disputados.
En la tierra de Fronaldo, la República de Biscotti ha sido agresivamente atacada por el Reino de Garette. Frente a la inminente derrota, la princesa Milchore convoca a un héroe que puede salvar al país. A su llamado acude Shinku Izumi, un muchacho de Japón que se encuentra cursando la preparatoria. Mientras permanezca en Fronaldo su mision es convertirse en héroe suficientemente poderoso para derrotar a sus enemigos mientras aprende las normas peculiares de batalla en este nuevo y extraño mundo.
La historia se centra en Kakazu Kio, un estudiante de primer año de la escuela de alto en Okinawa. Durante una ceremonia en memoria de uno de los antepasados de su familia. Una misteriosa chica con orejas de gato se le aparece a sí misma presentándose como Eris y afirma que ella es un extraterrestre. En poco tiempo, los fieles fanáticos de los extraterrestres y una misteriosa agencia del gobierno persiguen a Eris, pero una amiga de la infancia de Kio, Manami, que quiere seguir los pasos de su padre en la CIA, captura a Eris. Kio se da cuenta que tiene que proteger a Eris de todo el mundo.
Un estudiante de escuela secundaria superior llamado Yotaro pensó que era hijo único - hasta que conoció a su verdadera madre y descubrió que ella tiene 19 hijas, de 0 a 18 años de edad. Él termina viviendo con su "verdadera familia".
Un estudiante promedio del instituto, llamado Haruaki Yachi recibe un paquete misterioso y pesado de su padre en el extranjero. Esa noche a Haruaki lo despierta un sonido proveniente de la cocina donde encuentra a una chica desnuda robandole comida. El susto que se lleva Haruaki por esta chica es el primero de muchos que están por venir.
En un planeta llamado "Life Core", que existe paralelamente con el mundo de los humanos normales, existen unas mujeres conocidas como Jūden-chan (充電ちゃん juuden chan?, lit. niñas cargador), las cuales patrullan el mundo humano en busca de personas que se sienten deprimidas y con mala suerte. Su trabajo consiste en recargar a estas personas con la ayuda de la electricidad, con el fin de mejorar su ánimo; normalmente sin ser vistas por ojos humanos. Una de estas Jūden-chan, Plug Cryostat, conoce, accidentalmente, a un joven, llamado Sento Oumi, que es capaz de verla, cuando estaba a punto de recargar a su hermana.
