Ghost Hound se ubica en la modesta ciudad de Suiten, situado en una desolada región en la isla de Kyūshū. La historia sigue las experiencias de tres niños que han tenido experiencias traumáticas en la infancia de la que han aprendido a transferir sus almas a un mundo paralelo conocido como el “Unseen World”. Sin embargo, sometidos a un cambio, con sus fantasmas empezando a aparecer en el mundo real provocan la alteración en formas impredecibles.