Situado en un mundo gótico de fantasia, ésta es la historia de Teito Klein, un esclavo huérfano quien se conviete en el mejor estudiante de la academia militar. Sin embargo, un inesperado giro del destino hacen que él sea perseguido por las fuerzas del Imperio Barsburg. Ahora como un convicto prófugo, Teito es protegido por la iglesia y su ley del santuario. Ahí, él descubre muchos misterios que lo rodean a él, a la iglesia y al mismo Imperio. El hecho de que él puede estar conectado con un rey derrocado y la mística Piedra de Dios, “El Ojo de Mikhael”, lo convierten en el blanco del Imperio. Afortunadamente, la iglesia está bajo la protección del misterioso 07 Ghost.
Yukinari, es un estudiante como cualquier otro, con la unica diferencia que siempre ha sido mas bajo de estatura que los demas de su edad y a causa de eso las mujeres siempre lo han tratado mal; por este motivo, desarrolló una ginefobia (fobia a las mujeres) por lo que si las mujeres lo tocan, le sale urticaria (algun tipo de alergia en la piel). La vida de Yukinari cambiara completamente cuando por casualidades de la vida viaja a traves de la bañera de su casa hasta otro planeta llamado Seiren donde se encuentra con Miharu quien es la unica mujer a la que realmente puede tocar sin sufrir de urticaria (y que ademas es de su estatura), Seiren es un planeta donde el 96% de la población son mujeres y los hombres son muy disputados.
En la tierra de Fronaldo, la República de Biscotti ha sido agresivamente atacada por el Reino de Garette. Frente a la inminente derrota, la princesa Milchore convoca a un héroe que puede salvar al país. A su llamado acude Shinku Izumi, un muchacho de Japón que se encuentra cursando la preparatoria. Mientras permanezca en Fronaldo su mision es convertirse en héroe suficientemente poderoso para derrotar a sus enemigos mientras aprende las normas peculiares de batalla en este nuevo y extraño mundo.
Cuenta la historia de un joven mago llamado Natsu en la búsqueda de su maestro y padre adoptivo Igneel que resulta ser un dragón. Por ello se unió a Fairy Tail, un gremio de magos que es famoso por los destrozos y daños que provocan en diversas ciudades. Natsu conoce a Lucy, una guapa muchacha cuyo sueño era ingresar a un gremio de magos, específicamente, a Fairy Tail, lo cual consigue gracias a la ayuda de Natsu. De ahí en adelante, la historia sigue los movimientos de esta pareja de magos los cuales se ven envueltos en un sin número de aventuras antes de conseguir la meta final de encontrar a Igneel.
La historia sigue a Saya Kisaragi como alumna de segundo curso del Instituto Privado Sanabara, donde lleva una vida normal y disfruta de su diario vivir.Sin embargo,su padre le encomienda la misión como heredera del templo Ukishima de acabar con los Antiguos usando la espada Mikami(Espada de los dioses) para preservar la paz en su instituto y proteger a la ciudad del peligro de estos seres.A lo largo de sus encuentros con estos seres, descubrirá variados secretos que hará cuestionarse lo enigmáticos que son hasta encontrar alguna verdad,pero...el destino le aguardará muchas sorpresas a Saya
